Убедиться, что диск в полном порядке как логически, так и физически, можно, выполнив процедуру его проверки. Системное средство проверки диска позволяет выявить и устранить логические ошибки в файловой системе. С его помощью можно также выявить физические дефекты на магнитной поверхности, а соответствующие им кластеры логической структуры исключить из использования.

Логические ошибки в файловой системе возникают, когда дисковая операция выполняется не до конца. Если часть нужных данных записана на диск, а часть — нет, возникают противоречия. Насколько удачно может справиться с ними сама файловая система, это уже другой вопрос.

Так, например, файловая система защищена от подобных проблем очень хорошо. В ней действует так называемый механизм транзакций. Суть его в том, что если файловая операция не доведена до конца, она полностью отменяется. Нарушение логики в системе NTFS возможно, но только если программа ведет запись данных в обход файловой системы (и в обход операционной системы) или при аппаратном сбое.

В устаревших файловых системах типа FAT и FAT 32 механизм транзакций не действует и потому защита от логических ошибок практически отсутствует. На жестких дисках, отформатированных в этих форматах, логические ошибки могут возникать регулярно.